RNAcompete results for RNCMPT01403 / SSBP1 (Species: Homo_sapiens)

Full-length ucRBP

Motif

Aligned top 7-mers

Set A

Set B

All data

--AAUGUAA- -AAUGUUA- -AAUGUUA-
-GAAUGUA-- -AAUGUAA- -AAUGUAA-
--AAUGUUA- --AUGUUAA GAAUGUA--
--AAUGAUA- -AAUGAUA- -AAUGAUA-
--GAUGUAA- --AUGAUAU --AUGUUAA
-GAAUGUU-- -GAUGUUA- -GAUGUUA-
---AUGUUAA GAAUGUA-- -GAUGUAA-
--GAUGUUA- --AUGUUAU GAAUGUU--
AGAAUGU--- -GAUGUAA- --AUGUUAU
---AUGUUAU -GAUGAUA- -GAUGAUA-

7-mer scatter plot

Top 7-mers by Z-score

Set A

score

Set B

score

Set A+B

score

AAUGUAA 12.79 AAUGUUA 16.41 AAUGUUA 14.47
GAAUGUA 11.99 AAUGUAA 12.93 AAUGUAA 13.17
AAUGUUA 11.58 AUGUUAA 12.31 GAAUGUA 12.04
AAUGAUA 11.10 AAUGAUA 11.49 AAUGAUA 11.54
GAUGUAA 9.56 AUGAUAU 11.41 AUGUUAA 11.17
GAAUGUU 9.42 GAUGUUA 11.30 GAUGUUA 10.62
AUGUUAA 9.39 GAAUGUA 11.26 GAUGUAA 10.45
GAUGUUA 9.37 AUGUUAU 10.90 GAAUGUU 10.24
AGAAUGU 9.36 GAUGUAA 10.61 AUGUUAU 10.18
AUGUUAU 9.19 GAUGAUA 10.57 GAUGAUA 9.87